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甲基化检测

提供一站式甲基化检测解决方案,可做MSP,BSP,HRM,焦磷酸测序

甲基化研究思路:
1. 寻找甲基化位点
    1) 甲基化二代测序寻找甲基化位点;
    2) 对照组和实验组进行甲基化芯片检测,找到相关的甲基化位点;
    3) 一些相关研究显示某些基因存在表达量降低的现象,可预测该基因是否存在CpG岛;
    4) 根据文献寻找相关基因的甲基化位点。
2. 验证甲基化位点,并进行甲基化程度分析
    采用对照组和实验组样本进行甲基化验证。
    1) MSP方法:可进行特定位点甲基化验证,适用于甲基化芯片后的结果,无法进行甲基化程度分析;
    2) BSP克隆测序法:验证某些相关基因的甲基化位点,并计算出精确的甲基化程度百分比;
    3) HRM法:适用于大批量样本甲基化验证,并能计算出甲基化程度范围;

    4)焦磷酸测序法: 验证某些相关基因的甲基化位点,并计算出精确的甲基化程度百分比。

3. 分析甲基化位点与研究的相关性
    根据对照组和实验组样本的检测结果,分析与研究的相关性。
    1) 比较对照组和实验组相同甲基化位点甲基化是否有差异;
    2) 比对对照组合实验组相同基因启动子区甲基化程度是否有差异;
4. 验证启动子发生甲基化的基因的表达量变化
    采用荧光定量PCR的方法检测相关基因的表达量,如果表达量降低,可能由于启动子区发生甲基化导致的,从而影响该基因所在的某些通路,导致一些疾病,或表型发生变化;如果没有发生变化,可能由于发生甲基化的区域与转录因子之间关联不是很密切,从而不会影响基因的表达。



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